Ciao,
anni fa mi trovai con un problema simile
https://www.freegis-italia.org/index.php...4&catid=19
Secondo me puoi partire da quel punto:
1) devi avere DEM e raster con stesso sistema di riferimento;
2) fai generare all'ortofoto una griglia di punti;
3) a tali punti associ la quota del DEM.
É da provare, ciao